Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh19G5E8H9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh19G5E8H9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms