Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcf11G3X9Z4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms