Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgxb3G3X9M3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms