Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zc3h12bG3X9I7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms