Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd5G3UW60 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms