Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG7

N4bp2, NEDD4-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2F8VQG7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
N4bp2F8VQG7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp2F8VQG7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms