Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6F8VPZ5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms