Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colca2F8VPY8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Colca2F8VPY8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms