Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arid4aF8VPQ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms