Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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