Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D430041D05RikF6ZGR6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms