Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SmgcF6VRN1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmgcF6VRN1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms