Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms