Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngap1F6SEU4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms