Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm340F6RGI3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms