Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms