Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms