Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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