Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms