Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms