Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Simc1E9Q6E9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms