Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtproE9Q612 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms