Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC005561E9Q5E2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC005561E9Q5E2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms