Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip11E9Q512 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms