Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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