Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms