Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6430550D23RikE9Q1X6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms