Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc171E9Q1U1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms