Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrp3E9Q1T6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp3E9Q1T6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp3E9Q1T6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp3E9Q1T6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp3E9Q1T6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp3E9Q1T6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp3E9Q1T6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp3E9Q1T6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp3E9Q1T6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp3E9Q1T6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp3E9Q1T6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp3E9Q1T6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms