Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt78E9Q0F0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms