Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms