Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf11E9PZM7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Scaf11E9PZM7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms