Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp54bE9PXC0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms