Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms