Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms