Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim30bE9PVL6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms