Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms