Protein–RNA interactions for Protein: E0CXI6

Gm5286, Predicted gene 5286, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5286E0CXI6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5286E0CXI6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm5286E0CXI6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm5286E0CXI6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm5286E0CXI6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm5286E0CXI6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm5286E0CXI6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm5286E0CXI6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5286E0CXI6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5286E0CXI6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms