Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms