Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Fam46aD3Z5S8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam46aD3Z5S8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam46aD3Z5S8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam46aD3Z5S8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Fam46aD3Z5S8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Fam46aD3Z5S8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam46aD3Z5S8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Fam46aD3Z5S8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam46aD3Z5S8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms