Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430403G16RikD3Z5L4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms