Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hfm1D3Z4R1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hfm1D3Z4R1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms