Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc8D3YZV8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms