Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc6D3YZP9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms