Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rexo5D3YW29 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms