Protein–RNA interactions for Protein: D3YV94

Lce6a, Late cornified envelope 6A, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce6aD3YV94 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lce6aD3YV94 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lce6aD3YV94 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms