Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms