Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3259D3YUK0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3259D3YUK0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms