Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2d4D3YUH6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms