Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms